IGV：基因组数据可视化

基因组数据的交互查看

IGV用于在基因组坐标上查看测序相关轨道，可辅助检查比对、覆盖情况、变异区域及多种注释。它的价值在于把可疑结果放回局部数据背景中观察，而不是替代完整的数据处理或统计流程。开始查看前，应先核对参考基因组版本，否则轨道可以加载却仍可能对应错误位置。

数据与环境准备

准备与参考基因组版本匹配的数据文件及所需索引，记录样本编号、分析流程和关键区域坐标。对涉及个人样本的数据，先确认所在环境和访问方式符合本项目的数据管理要求。

建议的入门工作流

1. 选择正确的参考基因组，加载样本与注释轨道，确认索引及坐标范围有效。
2. 从整体覆盖情况进入目标区域，比较不同样本的局部表现。
3. 保存会话和必要的区域截图，记录坐标、显示设置以及需要进一步核实的问题。

结果复核与常见问题

局部查看不能替代质量控制或变异验证。留意覆盖深度、比对质量、重复区域和链方向等背景信息。截图应附参考版本及区域坐标，以便其他人员重新打开相同区域进行检查。

安装、许可与项目记录

桌面版的Java和系统要求以官网为准；另有无需安装的IGV-Web。

从下方官网入口核对当前发行包与文档，先用少量数据验证环境。记录软件版本、关键参数、输入数据来源和输出文件位置，保留能够重新执行的步骤；重要项目升级前先保存原环境并比较结果。