CGH芯片服务

作为疾病的一项生物标志，染色体水平的缺失、扩增等变化已成为科学家研究的热点。以往科学家运用传统的染色体核型分析方法（如染色体区带染色分析，FISH等）已获得许多染色体结构变异的可贵进展。但传统的方法实验操作繁琐，分辨率低，不能覆盖全基因组，难以提供染色体变异位点的精确定位。基于基因芯片的比较基因组杂交技术, aCGH（array-based Comparative Genomic Hybridization）平台的出现解决了上述问题。这种平台能够支持研究人员通过微阵列准确研究与疾病有关的染色体的变化，目前aCGH已经广泛应用于研究肿瘤发生过程中伴随的基因变化，如染色体的畸变等； 通过研究基因拷贝数目的变化，寻找新的原癌基因或抑癌基因； 揭示生物体抗药性的机制及代谢过程中可能发生的基因组变化； 发现新的生物标记，可用于临床诊断、疾病的分型等研究领域中，大大加速了人类对基因组DNA结构变异在遗传疾病中意义的理解。 

服务相关

样品要求 

1) 来源于新鲜组织，细胞或EDTA抗凝血或FFPE（只适用于ULS法）； 
2) DNA浓度> 75ng/μl，溶解在水或TE中； 
3) A260/A280 在1.7和2.0之间； 
4) A260/A230 > 1.5； 
5) 必须去除RNA。 

服务流程 
步骤1：DNA抽提、样品质检 
步骤2：样品酶切 
步骤3：用荧光染料分别标记实验组和对照组基因组DNA； 
步骤4：标记后样品纯化、定量； 
步骤5：样品混合后与CGH芯片杂交； 
步骤6：芯片扫描，数据读取和分析； 
步骤7：提供服务报告。 

服务报告内容

1) 实验图像： DNA 质检电泳图、CGH芯片扫描图（Jpg格式）；2) 实验数据：包括原始数据和处理数据。
a) 原始数据包括了每个探针点(probe)的信号值，红色荧光和绿色荧光的信号比值等。
b) 处理数据包括所有拷贝数变化的探针或者区段,提供Genomic Workbench软件按缺省值进行分析的结果（即使用z-scoring算法，threshold=4，片段大小为1M时的结果）。3) 实验文件：
a) 设计文件：该文件是进行图像到数字转换以及数据分析时相关软件所需要使用的信息文件（该文件是给计算机使用的），可以将探针点与基因信息关联起来。
b) 操作指南：《DNA 抽提指南》，《CGH芯片实验操作指南》和《数据分析软件CGH Analytics 使用指南》4) 报告文件：项目总结报告、DNA质检报告