AbSeq™抗体测序

北京安必奇生物科技有限公司作为抗体定制服务供应商，专注于单克隆抗体的生产和工程领域。利用多种抗体文库技术（包括噬菌体展示、细菌展示和酵母展示）以及杂交瘤技术，实现对人、猴、兔、羊、鸡、狗、骆驼、羊驼、牛、小鼠、大鼠、豚鼠及鲨鱼的单克隆抗体生产。此外，在抗体大规模制备服务方面，能制备利用细菌生产的单链抗体、双功能抗体、串联scFv、miniantibody和Fab，以及哺乳动物细胞表达minibody、嵌合抗体和IgG。

一、平台特点

北京安必奇生物科技有限公司采用DASS（Database Assisted Shotgun Sequencing ) 技术，通过使用质谱仪和数据处理算法，生成大量序列信息，进而运用计算程序对MS/MS光谱从头测序，利用其内部数据挖掘工具使得我们从MS/MS光谱数据中提取目标抗体序列信息。

• 运用DASS技术对V、J、C片段测序

目前世界上的一些数据库（如NCBI）虽然包含抗体V、J、C片段序列，但是在抗体成熟的过程中，一个B细胞中的抗体基因要经历体细胞突变的过程才会产生高亲和力的成熟抗体。我司的计算方法容错率高，并能匹配相应物种的突变肽段。使得肽段都会被检测到，而且每一个氨基酸位点都会生成20-27条MS/MS光谱，因此，对于难测序的高脯氨酸（proline）和精氨酸（arginine）肽段也可实现测量，而且不需要再进行额外的Edman测序来辅助测序。

• CDR3区测序

抗体轻链的 CDR3 区多由胚系基因编码，而重链的 CDR3 区则由 D 基因编码。D基因大部分区域由于受到核酸酶及末端转移酶等重组酶的作用而发生基因重排，导致抗体重链 CDR 区在数据库中无法进行同源比对。一般来说，一个成熟的抗体只有 1-4 个氨基酸是由 D 基因编码的，而其他序列都是基因重组排的结果，而只能对其进行 de novo 测序。

通过多种酶切来产生多种互相重叠的肽段，以测得较长的未知氨基酸序列。高质量的质谱数据域高效率的数据挖掘算法的结合，使我们对抗体CDR3 区域的解读更为有力，最终可以测得数据库中无同源序列的，20kDa的蛋白。

• 等重氨基酸测序