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基因组文库(Genomic Library)构建

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最后更新: 2014-12-26 15:29
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用限制性内切酶切割细胞的整个基因组DNA,可以得到大量的基因组DNA片段,然后将这些DNA片段与载体连接,再转化到细菌中去,让宿主菌长成克隆。这样,一个克隆内的每个细胞的载体上都包含有特定的基因组DNA片段,整个克隆群体就包含基因组的全部基因片段总和称为基因组文库。基因文库=基因组文库+cDNA文库 。 

 

载体的种类和特征

 

受体细胞

结构

插入片段

举例

质粒

E.coli

环状

很小,<8kb

pUC18/19 ,T-载体
pGEM3z

λ噬菌体

E.coli

线状

9-24kb

EMBLλgt系列

丝状噬菌体及噬菌粒

E.coli

环状

<10kb

M13系列

粘粒载体

E.coli

环状

35-45kb

 

BAC

E.coli

环状

300kb

 

PAC

E.coli

环状

100-800kb

PCYPAC

YAC

酵母细胞

线性染色体

100-2000kb

 

MAC

哺乳动物细胞

环状

>1000kb

 

病毒载体

动物细胞

环状

 

SV40 载体,昆虫杆状病毒载体

穿梭载体

动物细胞和细菌

环状

 

pSVK3质粒,PBV,Ti质粒,

基因组文库构建步骤

1、载体: 噬菌体:48.5kb,插入型(最多可容纳9kb)、取代型(可容纳 38-51kb,最适19-20kb), EMBL, Charon 粘性质粒(Cosmid):4-6kb, 质粒+噬菌体的性质,可容纳大片段的外源基因,最多可容纳46kb。 酵母人工染色体克隆体系(YAC,Yeast Artificial Chromosome  Cloning System) 插入大小200—1000kb 

2、 载体DNA的制备: 高分子量的外源DNA 100-150kb载体DNA酶切反应-----载体臂的纯化-----载体脱磷处理 (常用BamHI)   (蔗糖密度梯度离心)  (碱性磷酸酶)

3、连接和包装:外源片段与两臂之间的比例,包装蛋白 

4、感染宿主菌:选择合适的宿主菌,LE392, NM538, NM539, KW251等

5、基因组文库的保存和扩增: 

6、测滴度,要在106fu以上

7、保存:氯仿4℃,7% DMSO -70℃

您需要提供 

动物的血或细胞、新鲜植物叶片、活体昆虫或纯化好的DNA样品。

我们提供

1、文库(10%甘油菌)以及菌落效价(CFU/ml);

2、随机抽样测序结果。
服务价格    电话详询

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