首页/供应/技术服务/分子生物/DNA测序
全长鸟枪法测序
全长鸟枪法测序全长鸟枪法测序全长鸟枪法测序
点击图片查看原图

全长鸟枪法测序

面议
品牌
biosice
发货期限
付款后 3 天内发货
所在地
北京
有效期至
长期有效
最后更新
2014-12-26 15:24
浏览次数
174

详细说明

 全基因组测序主要有二种策略,一种是分级鸟枪法测序,另一种是全基因组鸟枪法测序.微生物是一种十分重要的遗传资源,运用全基因组鸟枪法可以方便、快捷地完成其基因组的测序任务.。

 

公司拥有ABI3730xl测序平台和齐全的配套设施,其全基因组鸟枪法测序(Whole Genome Shotgun Sequencing),无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱,采用最经济有效的实验设计方案,直接将整个基因组打成不同大小的DNA片段构建Shotgun文库,对文库进行随机测序,最后运用生物信息学方法将测序片段拼接成全基因组序列。公司测序平台目前已经完成十余例50kb到500kb大小基因组 测序服务项目,积累了丰富的经验。

 

全基因组鸟枪法测序的主要步骤是:第一,建立高度随机、插入片段大小为1.6kb到4kb左右的基因组文库。克隆数要达到一定数量,即经过两端测序的克隆片段的碱基总数应达到基因组大小的6到10倍。第二,高效、大规模的克隆双向测序。第三,序列拼装。借助Phred, Phrap, Consed 软件进行序列组装,产生一定数量的contig。第四,填补缺口。有两种待填补的缺口,一是没有相应模板DNA的物理缺口,我们通过PCR的方法进行填补;二是有模板DNA但未测到的序列缺口。我们直接在模板DNA上设计引物测序。

 

项目适用范围

BAC、Fosmid、cosmid、线粒体、叶绿体等

服务内容

基本服务内容:shotgun文库构建,大规模测序,序列组装。

高级服务内容:信息处理和分析,包括比较基因组、基因功能注释和分类。

样品要求

动物、植物、微生物组织请提供足量的新鲜样品(4℃保存,不超过一天)或将新鲜样品立即存于液氮或-80℃,一周内寄样。

已纯化 DNA要求浓度>10ng/ul ,最小量>20ug,OD 260 /OD 280值:1.80~2.00

0 条相关评论

本企业其它产品

更多 →