SNP分型服务

本公司提供的SNP分型服务，采用TaqMan探针法（定量RCR）进行SNP检测，客户根据自己需求挑选出自身需要的SNP后，提交给我们进行引物与探针设计与合成。通过进行样品基因组DNA抽提，并进行定量PCR检测，帮您轻松完成大量样品的检测与分析。

TaqMan实验原理：

针对染色体上的不同的SNP位点分别设计1对PCR引物和TaqMan探针，进行实时荧光PCR扩增，该探针的5’端和3’端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶液中有PCR产物时，该探针与模板退火，即产生了适合于核酸外切酶活性的底物，从而将探针5’端连接的荧光分子从探针上切割下来，破坏两荧光分子间的PRET，发出荧光，通常用于少量SNP位点分析。

TaqMan实验流程：

1、 抽提DNA

2、引物/TaqMan探针设计与合成

3、定量PCR

4、测序

5、统计与分析

技术特点

★适合位点数量少，样本通量高的检测（每个位点需要合成两条探针，探针合成费用高）。

★应用定量PCR仪进行定量检测。

★操作简便，只需一步 PCR 反应

★结果清晰直观

★可采用ABI合成的探针或国产探针

★两个SNP位点之间太近或者SNP序列附近有特殊结构，设计不出来探针。

送样要求

1、组织样本：-20℃或-80℃低温冰箱中保存，液氮或者干冰运输；市内或短途运输可冰袋运输。若提供的材料为新鲜组织、血液细胞等生物材料，请提供足够提取2ug以上基因DNA的材料量。

2、DNA样本：体积≥50ul，浓度≥50ng/ul，DNA总量≥2ug，纯度 OD260/280 在1.7～1.9之间，不含PCR抑制剂，须注明准确浓度。样品须低温冰袋运输。

3、血液样本：要求保存于抗凝管中或冻存管中，体积大于2ml，请用干冰运送，保证DNA不降解。

4、样品为石蜡包埋组织切片的，要求提供10张组织切片光片（面积>10mm×10mm,厚度约5-10um）。

服务说明

1、需要提供的材料包括：组织、细胞、血液等样品材料或纯化好的DNA。

2、需要提供目的SNP位点的rs号或该位点上下游各200bp的序列以及突变的类型。

3、某些SNP由于上下游序列中含有其他SNP位点或特殊结构，无法采用TaqMan探针方法检测，遇到这种情况我们会在初期进行分析后通知客户选择其他方式。

实验结果

1、提供实验条件，包括引物和探针序列、试剂名称、仪器型号和操作步骤等。

2、提供各样本、各SNP位点聚类图和分型表。

3、可以提供部分原始数据图谱。