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AxyPrep 基因组DNA小量试剂盒

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所在地: 北京
有效期至: 长期有效
最后更新: 2017-03-20 12:09
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公司基本资料信息
详细说明
 本试剂盒采用独特的裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组

DNA 的目的。每次制备可获得多至20 μg 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD、RFLD

等分子生物学实验。

 

一、试剂盒组成、贮存、稳定性

     说明书,耗材:DNA 制备管、小量滤器、2 ml 离心管、1.5 ml 离心管

     RNase A:50 mg/ml,室温保存。

     Buffer G-A:裂解液,室温密闭贮存。

     Buffer G-B:蛋白去除液,室温密闭贮存。

     Buffer DV-A:Buffer DV 的制备液,请参照实验准备Buffer DV 的配制方法配制,室温密闭贮存。

     Buffer DV:相分离液,室温密闭贮存。

     Buffer BV:DNA 结合液,室温密闭贮存。

     Buffer W1:洗涤液,室温密闭贮存。

     Buffer W2 concentrate:去盐液。使用前,按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇,混合均匀,室温密

闭贮存。可用100%乙醇或95%乙醇。

     Eluent:2.5 mM Tris-HCl,pH 8.5,室温密闭贮存。

二、注意事项

     Buffer G-A、Buffer G-B、Buffer BV 和Buffer W1 含刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套和眼镜,

避免沾染皮肤、眼睛和衣服,谨防吸入口鼻。若沾染皮肤、眼睛时,要立即用大量水冲洗,必要时寻

求医疗咨询。

三、实验准备

     1. 第一次使用时,在Buffer W2 concentrate 中按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇并混合均匀。

     2. 制备Buffer DV:取2 ml Buffer DV-A,125 ml 异丙醇,75 ml 异丁醇,加入提供的250 ml 试剂瓶

中,混合均匀。

     3. 4℃预冷Buffer DV。

     4. 准备65℃水浴。

     5. 使用前检查Buffer G-A 和Buffer G-B 是否有沉淀析出,若出现沉淀,请于65℃水浴加热至沉淀完

全溶解后再使用。

     6. 将Eluent 或去离子水加热至65℃有利于基因组DNA 的充分洗脱。

四、操作步骤

从样品中提取基因组DNA

不同的样品采用不同的匀浆步骤。

【从动物组织中提取基因组DNA

步骤1-3 请根据不同的实验条件选择对应的操作

使用研钵进行匀浆

     1. 取1-20 mg 动物或人组织,移入冰水浴预冷的研钵中,快速、用力研磨成匀浆。

* 列组织请加液氮研磨至粉末状后,将研钵置于65℃水浴,当粉末开始融化时继续研磨1 min,匀浆后加入650 μl

Buffer G-A 和0.9 μl RNase A,再进入步骤3 的操作下。

      A. 富含DNA 酶的胰脏,脾脏,胸腺,淋巴等组织。

      B. 富含胶原蛋白的皮肤、肌健等组织。

      C. 富含角质蛋白的组织或坚硬的组织如骨骼等。

     2. 加入650 μl Buffer G-A 和0.9 μl RNase A 后温和地研磨30 s。

     3. 收集650 μl 研磨好的组织匀浆并转入2 ml 离心管。如匀浆体积不足650 μl,补充Buffer G-A 至650 μl,65℃水浴5 min。

【从植物组织中提取基因组DNA

     1.按下表称取适量的新鲜植物组织(如选用的是冷冻干燥的组织,则组织用量减半)。剪成小块放入研钵中;如从培养的植物细胞中提取基因组DNA,收集2×103-1×107 培养的植物细胞,10,000×g 离心1 min,加入150 μl 水充分悬浮细胞并转入研钵中,加入液氮,使组织冷冻完全后,快速、用力研磨至粉末状。研磨时应间断加入液氮以防止组织融化,研磨充分后将研钵放入65℃水浴至样品粉末刚开始融化。

     * 表1 新鲜植物样品使用量按下表收集

     植物花或叶片 10-100 mg

     植物茎 ≤240 mg

     植物根 ≤240 mg

     植物种子 ≤240 mg

     * 如新鲜植物叶超过120 mg 或干植物叶超过60 mg,加入1300 μl Buffer G-A,匀浆后将样品分到两个2 ml 离心管中,然后按照步骤1-7 平行操作两管,第8 步和接下来的步骤合并到一管操作,以提高洗脱的DNA 的浓度。

     * 样品研磨应充分,否则严重影响基因组DNA 的得率。

     2. 加入700 μl Buffer G-A 和1.2 μl RNase A 贮存液,用力碾磨30 s。

     3. 转移650 μl 研磨好的匀浆至2 ml离心管中,如匀浆体积不足650 μl,补充Buffer G-A 至650 μl,65℃水浴15 min。

     * 富含纤维的根/茎等组织或富含淀粉、蛋白质的种子等样品,可延长水浴时间至60 min。

【从培养细胞中提取基因组DNA

     步骤1-2 应根据培养细胞的类型来操作,若从植物细胞中提取基因组DNA,请按步骤(从植物组织中提取基因组DNA)来匀浆

      A. 悬浮培养的动物细胞或新鲜分离的动物组织单细胞悬液

       1A. 用2 ml 离心管收集1×103-2×106 细胞悬浮液,2,000×g 离心5 min,弃尽上清。

       2A. 加入150 μl 去离子水或PBS 悬浮细胞,加入500 μl Buffer G-A。

      B. 单个细胞培养或96孔培养板、24 孔培养板、12 孔培养板和6孔培养板细胞培养

       1B. 尽可能的丢掉上清液,加650 μl Buffer G-A 到每孔中,室温静置1 min。

       2B. 用吸头来回吸注几次,转移650 μl 匀浆至2 ml 离心管,如匀浆体积不足650 μl,补足Buffer G-A 至650 μl。加入0.8 μl RNase A,旋涡振荡15 s,室温静置1 min。

【从酵母中提取基因组DNA

      1. 收集2×106-5×107 酵母细胞,10,000×g 离心 1min。用150 μl 水悬浮酵母细胞并转移至研钵中,加入液氮,待样品被完全冷冻后,快速、用力研磨至粉末状。将研钵放入65℃水浴至样品粉末刚开始融化时进入下一步操作。

     * 当OD680 为1 时,酵母浓度为3×107 细胞/ml。

     * 酵母细胞壁较为坚韧,应适当延长研磨时间和研磨次数以确保充分破碎酵母细胞壁。

     * 研磨时应及时加入液氮,防止样品在研磨时融化。

     2. 加入600 μl Buffer G-A 和1.2 μl RNase A 贮存液,快速用力碾磨30 s。

     3. 转移650 μl 研磨好的匀浆至2 ml 离心管中,如匀浆体积不足650 μl,补充Buffer G-A 至650 μl,65℃水浴10 min。

【两相分离去除蛋白和其它杂质

     4. 加入400 μl Buffer G-B 和1 ml Buffer DV(4℃预冷),用力混合均匀。12,000×g 离心2 min。

     * 请在实验前按照实验准备步骤2 准备Buffer DV.

     5. 尽可能丢弃上相,保留相间沉淀和下相。加入1 ml 4℃预冷Buffer DV,用力混合,12,000×g 离心2 min。

【基因组DNA 的纯化】

     6. 丢弃上相,将下相转移至滤器(滤器置于2 ml 离心管中),12,000×g 离心1 min。

     * 上相无需完全弃尽,在转移无色下相时偶有混入的上相,可在Tip 头内迅速分相,便于丢弃。

     * 如在转移过程中吸入少量界面沉淀,不必去除,可过滤除去。

     * 有色上相务必除尽,否则将抑制DNA 结合到silica 膜上。

     7. 弃滤器,在滤液中加入400 μl Buffer BV,混合均匀。

步骤8-11,可选择离心法或负压法

     A.负压法

      8A. 将DNA 制备管插到负压装置的插口上,将步骤7 的混合液移到制备管中,开启并调节负压装置至-20-30 英寸汞柱。

      9A. 保持负压,加入500 μl Buffer W1,吸尽管中液体。

     10A. 保持负压,加入700 μl 已加入乙醇的Buffer W2,吸尽管中液体;已同样的方法再用700 μlBuffer W2 洗涤一次。

     * 确认在Buffer W2 concentrate 中已按试剂瓶上的指定体积加入无水乙醇。

     * 沿管壁加入Buffer W2 有助于彻底冲洗附在管壁上的盐分。

     * 两次用Buffer W2 冲洗能确保盐分被完全消除,消除对酶切反应的影响。

     11A. 将DNA 制备管放回2 ml 离心管中,12,000×g 离心1 min。

     B.离心法

      8B. 将DNA 制备管置于2 ml 离心管中,将步骤7 中的混合液移至制备管中,12,000×g 离心1 min。

      9B. 弃滤液,将制备管置回到原来的2 ml 离心管中,加入500 μl Buffer W1,12,000×g离心1 min。

     10B. 弃滤液,将制备管置回到原来的2 ml 离心管中,加入700 μl Buffer W2,12,000×g 离心1 min,以同样的方法,用700 μl Buffer W2 再洗涤一次。

     * 确认Buffer W2 concentrate 中已按试剂瓶上指定的体积加入无水乙醇。

     * 再次用Buffer W2 冲洗能确保盐份被完全清除,消除对酶切反应的影响。

     11B. 弃滤液,将制备管置回原来的2 ml 离心管中,12,000×g 离心1 min。

     12. 将DNA 制备管置于另一洁净的1.5 ml 离心管中,在silica 膜中央加100-200 μl Eluent 或去离子水,室温静置1 min,12,000×g 离心1min 洗脱DNA。

     * 将去离子水或Eluent 加热至65℃将提高洗脱效率。

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