Anthropic湿实验室首秀:AI发现新型CRISPR样酶系统
人工智能巨头Anthropic在过去一年中多次涉足生命科学领域,包括推出Claude Science生物信息学平台。近日,该公司宣布正式进入湿实验室科学,在旧金山湾区设立了一个由人工操作的实验室。公司在一份新闻稿中表示,该实验室自今年春季以来一直在悄然运营,并且已经取得了一项发现:“一种具有类似CRISPR特性的新型酶系统”。
AI驱动的“典型”分子生物学实验室
Anthropic生命科学负责人Eric Kauderer-Abrams对路透社表示,该实验室展示了AI被用于“造福世界的方式”。实验室的具体研究重点和工作方式尚不完全清楚。Kauderer-Abrams称,该 ventures 可能针对所谓的“不可成药”疾病,但公司发言人后来澄清,实验室不会仅专注于药物科学。路透社的匿名消息源称,公司的最终目标是实现自动化设置,由其AI Claude指挥机器人实验室单元,但Kauderer-Abrams也表示:“我们认为,要从事生物学研究,最终的测试仍然且将在一段时间内依赖于真实实验室工作。”这表明Anthropic至少目前采用的是人工优先的方法。
Anthropic在新闻稿中称,这个新 ventures “看起来像一个典型的分子生物学实验室”。其主要区别在于湿实验室的上游。Anthropic表示,团队的许多工作流程始于提示Claude处理与了解甚少的蛋白质相关的DNA序列,然后筛选出具有有趣功能的候选蛋白质,再由人类科学家团队进行测试。
首个发现:基于逆转录酶的CRISPR样系统
Anthropic称,该方法的第一个发现是基于逆转录酶(RT)的CRISPR样酶系统,逆转录酶将RNA写入DNA。一个简单的提示要求研究DNA序列数据库以寻找新的RT功能,导致950个AI代理进行了一整天的搜索,收集了超过20万个候选RT。在将这些候选缩减到20个最有希望的竞争者后,一个代理报告称,其中一个RT(此前已在研究中表征)还包含一个以前未被注意的串联重复阵列,这是一组重复的短DNA代码,是CRISPR样系统剪切粘贴活动不可或缺的部分。
在一份未经同行评审的配套技术报告中,Anthropic的科学家将这种新系统称为阵列相关RT(ART)。虽然目前尚不清楚ART的功能,但Anthropic的新闻稿引用了CRISPR先驱、麻省理工学院和Broad研究所研究员张锋的评论:“这是一个令人兴奋的例子,展示了AI代理如何为生物发现做出贡献。识别与逆转录酶相关的RNA重复阵列确实很有趣,值得进一步研究。”
Kauderer-Abrams对路透社表示,Anthropic的研究项目正在谨慎行事,注意竞争问题。Anthropic表示其项目不会进行临床试验。“我们不会与将药物推向市场作为业务的制药和生物技术公司竞争,”Kauderer-Abrams说。
但即使Anthropic的大型制药客户,如罗氏、基因泰克和百时美施贵宝,可能对这些声明感到放心,很明显,虽然该公司向生命科学界提供某些AI驱动工具,但其自己的项目将拥有外部学者无法企及的重型武器。《科学家》杂志7月报道称,一些学者担心像Claude Science这样的工具会迫使研究人员在资助AI代币或培训生之间做出选择。ART的发现由六名具名人类科学家组成的团队完成,也使用了2.1亿个代币。“有些事情我们可以在自己手中做得更快,”Kauderer-Abrams对路透社说。
来源:The Scientist(英文原文,生物航编译,内容以原文为准)