最近做常规PCR检测时遇到一个很头疼的问题:我的阴性对照(无模板对照,NTC)在琼脂糖凝胶上出现了与目的片段大小相近的条带,有时还伴随引物二聚体。同一批试剂之前都正常,最近换了新的引物和dNTP,操作环境也没变。请问这种NTC出条带的情况,污染来源应该从哪些方面系统排查?有没有推荐的排查顺序和去污染处理方法?
最常见原因:扩增产物或质粒的气溶胶污染NTC出现与目的片段大小一致的条带,最常见的原因是前次PCR产物或高拷贝质粒模板以气溶胶形式污染了试剂、耗材或移液器。扩增产物浓度极高,开盖、点样、电泳后处理都容易造成扩散;质粒则因拷贝数高,微量残留即可被检出。其次才是引物二聚体(条带通常较小、弥散)和试剂本身被模板污染。 系统排查顺序
去污染与预防建议
具体试剂浓度和程序参数请以所用产品说明书和预实验为准;涉及次氯酸钠等刺激性试剂时,请按实验室生物安全与化学品管理规定操作。 |