种子发芽受温度、光照、水分等外界因素的影响，同时种子本身的好坏也能影响其能否发芽。因此进行种子质量检测显得尤为重要。种子质量检测包括发芽率、纯度、净度、千粒重等项目，种子发芽试验通常要随机选取多组50~200粒种子不等，而千粒重的测定则需要选取多组1000粒的种子。以往在做这些项目检测的时候，往往需要在数种子这一块耗费大量的时间，有时为了保证数粒结果的准确性还需要重数一遍，严重影响了种子检测的效率和准确率。如果把数粒工作交给专业的种子计数器的话，便能解决种子计数的难题，使我们能在较短的时间内数出规定数量的种子样品。
另外，种子计数器还可应用在农田作物测产和考种过程中的种子计数。它采用先进的图像处理技术，根据距离变换原理、形态学、凹点切分等技术综合设计而成；设有高亮LED灯背光装置，可以把种子平铺在上面，使得背光清晰，拍摄出来的图像质量也更好；同时该仪器还设有手动修正功能，可以根据图像找出紧挨的种子或者太远造成的误计算的种子，通过添加“删除”做相应的修正，进一步提高种子计数器的识别效率和准确率。
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