基因与蛋白质的表达紧密相连，而代谢物则更多地反映了细胞所处的环境，这又与细胞的营养状态，药物和环境污染物的作用，以及其它外界因素的影响密切相关。因此有人认为，“基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能会发生，而代谢组学则告诉你什么确实发生了。”（Bill Lasley, UC  Davis）

代谢组学与转录组学和蛋白组学比较具有以下优点：

• 易于检测：代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化，从而使检测容易。

• 有数据库：代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列标签（EST）或者全基因组的数据库，目前有多个多的化合物库可以使用。

• 通用性强：由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的，所以研究中采用的技术为通用的，也易被人们所接受的。

• 结果直接：代谢物可反映生物系统的生理和病理状态，可以区分同种不同个体之间的表型差异等。

代谢组学分析通常有两种主要方法：
非靶向代谢组学

• 代谢谱分析（也称为差异表达分析），在一组实验和对照样品中，寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物；

• 鉴定，进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构；

• 解释，研究流程的最后一步,解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联。

靶向代谢组学

靶向代谢组学分析的重点是采用大量天然和生物变异样本, 验证预先确认的代谢物。需要用分析标准品进行定量分析。

同时，我们承接医学疾病分子机制整体课题外包服务。