研究肿瘤微环境中神经与癌细胞的相互作用是一项艰巨任务。这一复杂系统需要一系列先进方法，要求癌症神经科学研究者跳出常规思维来构建模型和分析数据。德克萨斯大学MD安德森癌症中心（The University of Texas MD Anderson Cancer Center）首席研究员Moran Amit的实验室开发了实验模型和创新分析技术，他近日就神经肿瘤微环境研究接受了专访。

常用体外模型：DRG共培养

Amit指出，大多数神经-癌细胞相互作用发生在感觉神经与肿瘤细胞之间，因此实验室常用背根神经节（dorsal root ganglia，DRG）模型。该模型通过将小鼠神经节与癌细胞在培养皿中共培养建立，可研究两种结构之间的物理、化学和电信号交互。

空间技术不可或缺

研究神经肿瘤微环境时，一个关键认知是：神经本身并不在肿瘤内部，实际观察到的是神经末梢。这给RNA测序或单细胞测序等现有技术带来挑战——解离肿瘤时，神经末梢会作为碎片被丢弃。多数测序技术依赖基于细胞核的细胞分离，无论神经元还是其他基质细胞。因此，基于RNA或蛋白质的空间技术对研究神经肿瘤微环境至关重要。Amit透露，其团队与Kunal Rai合作在MD安德森开发了表观遗传空间分析技术，目前尚未商业化，但处于领先地位。

数据分析与模型构建的双重挑战

技术挑战主要集中在分析流程上。使用空间技术获取细胞信息后，会产生大量难以分析和得出结论的数据。Amit表示，实验室正在开发空间分析流程，以解决数据是否真正代表肿瘤全部异质性的问题。

建模同样面临挑战。研究人员习惯将肿瘤微环境视为仅存在于肿瘤内部，但神经与肿瘤距离很远。例如，指尖的肿瘤，其支配神经的胞体可能位于半米外的脊柱旁。如何追踪特异性支配肿瘤的神经并将其采集用于后续分析，是另一技术难题。实验室常规使用染料或病毒示踪剂来解决这一问题。

神经电信号通信的独特性

Amit还强调，神经的电信号通信方式独特，不同于人体其他细胞的交互方式。研究神经与癌细胞之间的电信号相互作用需要特定方法。这并非挑战，而是癌症神经科学中需要特别留意的方面。

来源：BioTechniques（英文原文，生物航编译，内容以原文为准）