英国伯恩茅斯大学（Bournemouth University）的研究人员对来自家猫和家犬的700多个细菌基因组进行分析，发现其中存在多重耐药菌株，包括同样在人类中发现的高风险克隆。研究结果强调，伴侣动物在抗菌素耐药性（antimicrobial resistance, AMR）防控中可能扮演被忽视的角色。

全球基因组数据集揭示谱系多样性

抗菌素耐药性已成为全球重大健康挑战，识别耐药菌储存库、追踪传播途径和检测临床重要谱系至关重要。伴侣动物与人类密切接触，为细菌交换提供了大量机会，但针对宠物的监测远不如人类和家畜完善。肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）是一种高优先级耐药病原体，在全球造成大量发病和死亡，然而猫和犬相关菌株的全球基因组结构和谱系多样性仍不明确。

为此，研究人员汇集了来自25个国家、家猫和家犬的712个肺炎克雷伯菌基因组，构建了全球数据集。他们鉴定出263个序列型（sequence type），表明伴侣动物群体中谱系多样性丰富，但某些高风险谱系占主导地位，包括ST307、ST11、ST15和ST147。

与人类菌株高度重叠

研究团队将宠物相关细菌与超过38,000个人类肺炎克雷伯菌基因组进行比较，发现二者存在广泛重叠：约87%的宠物分离株属于也曾在人类中鉴定出的菌株。研究人员还检查了基因组中的抗生素耐药基因，发现赋予对两种临床重要抗菌药物——超广谱β-内酰胺酶（extended-spectrum β-lactamase）和碳青霉烯酶（carbapenemase）——耐药性的基因，在从家猫和家犬分离的肺炎克雷伯菌中广泛分布。值得注意的是，猫源分离株的多重耐药率（80%）高于犬源基因组（56%）。

其中ST147菌株尤其引人关注。研究人员对猫源ST147进行聚焦重组过滤的系统发育基因组学分析后，发现了一个密切相关的多重耐药簇，包含猫、犬和人类相关基因组。

监测意义与谨慎解读

总体而言，这些发现表明宠物可携带与人类高度相似的全球传播耐药谱系，支持将伴侣动物纳入靶向基因组监测。但作者也谨慎指出，他们的数据无法确定方向性、来源归属或宠物与主人之间的直接传播。

该研究负责人Stephen Fordham总结道：“这项研究并不能说明我们的宠物正在让我们生病，但它确实表明，在动物和人类中都可以找到非常密切相关的细菌菌株。宠物主人无需担忧，但这说明将宠物纳入更广泛的抗菌素耐药性理解和应对工作非常重要。”

来源：BioTechniques（英文原文，生物航编译，内容以原文为准）