组织切片与数字病理图像分析

QuPath用于大型图像和数字病理分析工作流，适合组织区域标注、对象检测及图像定量等科研任务。对全切片图像，应先区分组织区域、检测对象与最终统计单位，再选择标注和分析方法。软件输出是研究数据处理的一部分，不应把未经验证的分类结果直接当作诊断结论。

数据与环境准备

准备原始切片图像、扫描倍率或像素尺寸、染色信息和样本编号。检查图像是否包含焦点不清、褶皱、气泡或背景区域，并记录需要排除的部分。

建议的入门工作流

1. 建立项目并导入图像，核对每张图像的尺寸、染色与样本信息。
2. 在代表性区域建立标注，观察检测和分类结果，逐步校正参数。
3. 按明确的组织区域或样本单位导出测量数据，同时保存项目和分析步骤。

结果复核与常见问题

不要只在少量理想图像上评估方法。检查不同染色批次和扫描条件下的表现，区分训练区域与复核区域。报告结果时说明统计单位和图像排除标准，避免把同一切片中的大量对象误当作独立生物学重复。

安装、许可与项目记录

官网提供软件下载与文档入口；安装环境以官方说明为准。

从下方官网入口核对当前发行包与文档，先用少量数据验证环境。记录软件版本、关键参数、输入数据来源和输出文件位置，保留能够重新执行的步骤；重要项目升级前先保存原环境并比较结果。