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蛋白质作为生命功能的最终执行者，其重要性不言而喻，深入研究蛋白质的结构、功能以及他们之间的相互作用，将成为最终揭示疾病发生、发展和转化规律最关键的环节之一。SELDI-TOF-MS是由美国赛弗吉生物系统有限公司（现属Bio-Rad公司）开发的一种利用表面增强激光解离/离子化质谱技术的蛋白芯片分析系统，广泛应用于各类疾病特异性生物标志物的检测和筛选，蛋白质的相互作用研究，揭示蛋白酶的作用，测定血清中小分子物质的含量以及新药的研制和开发等领域。该系统在检测低丰度、低分子量蛋白方面有独特优势。
一、技术路线和方法：
二、生物信息学分析
2.1 基本数据分析
Part01：数据预处理
Part02：差异peak筛选
Part03：层次聚类分析
Part04：PCA分析
Part05：PLS-DA分析
Part06：OPLS-DA分析
Part07：决策树模型构建
Part08：差异蛋白鉴定
2.2 高级数据分析
Part09：差异蛋白互作网络构建
Part10：差异蛋白代谢通路分析
Part11：多组学数据关联分析（具备多组学数据）
三、蛋白组学平台及参考报价
| 蛋白组学平台 | <=20样品 | <=50样品 | >50<=100样品 | >100样品 | 货号 |
| SELDI-TOF-MS | 1000/sample | 750/sample | 650/sample | 600/sample | BT3000111 |
基本数据分析：1万元
高级数据分析：0.5-2万元
四、完成时间
2个月，（其中生物信息分析15个工作日）
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